Die Basalzellschicht der Mukosa ist als dunkles Band dichtstehender Zellen erkennbar.
Auf das nicht verhorndende Plattenepithel (Mukosa) folgt das bindegewebige subepitheliale Stroma und die glattmuskuläre Lamina muscularis mucosae. In der lockeren bindegewebigen Submukosa befinden sich seröse Schleimdrüsen. Unten im Bild die im distalen Abschnitt des Ösophagus glattmuskuläre Muscularis propria mit einer inneren zirkulären und einer äusseren longitudinalen Schicht.