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Bronchoalveoläre Lavage: Die Pneumozysten sind bereits im Papanicolaou-Präparat erkennbar. Charakteristisch ist das schaumige Material, das aus vielen kleinen Bläschen besteht. Im Zentrum der Bläschen erkennt man vielfach ein feines basophiles Granulum, das der Membranverdickung vitaler Pneumozysten entspricht. Dadurch erhält das Material ein Froschlaich-ähnliches Aussehen.